Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP2Q9BX26 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms