Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TUBB6Q9BUF5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms