Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms