Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms