Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP13-4Q3LI77 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms