Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FXNQ16595 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FXNQ16595 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FXNQ16595 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FXNQ16595 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FXNQ16595 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FXNQ16595 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FXNQ16595 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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FXNQ16595 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FXNQ16595 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FXNQ16595 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FXNQ16595 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FXNQ16595 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FXNQ16595 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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FXNQ16595 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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FXNQ16595 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FXNQ16595 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FXNQ16595 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FXNQ16595 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FXNQ16595 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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