Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DSC3Q14574 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms