Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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