Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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