Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms