Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD2P62316 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms