Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RORCP51449 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RORCP51449 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RORCP51449 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RORCP51449 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RORCP51449 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RORCP51449 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RORCP51449 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RORCP51449 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RORCP51449 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RORCP51449 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RORCP51449 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RORCP51449 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RORCP51449 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RORCP51449 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RORCP51449 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms