Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM4P49221 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
TGM4P49221 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms