Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms