Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

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Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHATP28329 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHATP28329 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHATP28329 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHATP28329 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHATP28329 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHATP28329 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHATP28329 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHATP28329 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHATP28329 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHATP28329 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHATP28329 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHATP28329 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHATP28329 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHATP28329 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHATP28329 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHATP28329 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CHATP28329 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CHATP28329 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHATP28329 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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