Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms