Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSPP15924 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSPP15924 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSPP15924 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms