Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFLP07196 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFLP07196 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms