Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBDO15205 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBDO15205 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBDO15205 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBDO15205 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBDO15205 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBDO15205 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBDO15205 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBDO15205 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBDO15205 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBDO15205 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBDO15205 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBDO15205 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBDO15205 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBDO15205 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBDO15205 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBDO15205 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBDO15205 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBDO15205 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBDO15205 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBDO15205 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBDO15205 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBDO15205 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBDO15205 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBDO15205 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms