Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms