Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX10Q9Y5X0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms