Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DTX4Q9Y2E6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms