Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL11Q9NVR0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL11Q9NVR0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms