Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms