Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNBD2Q96M20 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms