Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATG2BQ96BY7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms