Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E3Q969T4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms