Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFKQ969G6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms