Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms