Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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SSX1Q16384 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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SSX1Q16384 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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SSX1Q16384 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SSX1Q16384 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SSX1Q16384 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SSX1Q16384 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SSX1Q16384 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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SSX1Q16384 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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