Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
USF2Q15853 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
USF2Q15853 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
USF2Q15853 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
USF2Q15853 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF2Q15853 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USF2Q15853 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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