Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms