Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKAA1Q13131 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms