Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RAB40BQ12829 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RAB40BQ12829 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RAB40BQ12829 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RAB40BQ12829 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RAB40BQ12829 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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