Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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FAM27E3Q08E93 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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