Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms