Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms