Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms