Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TMEM258P61165 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms