Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms