Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR2IP36954 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms