Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCVRNP35243 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms