Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA9P31269 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA9P31269 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms