Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD247P20963 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD247P20963 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD247P20963 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD247P20963 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD247P20963 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD247P20963 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD247P20963 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD247P20963 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD247P20963 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms