Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPI1P17947 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPI1P17947 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPI1P17947 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPI1P17947 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPI1P17947 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms