Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms