Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTAP01040 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTAP01040 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTAP01040 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTAP01040 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTAP01040 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTAP01040 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTAP01040 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTAP01040 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTAP01040 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTAP01040 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTAP01040 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTAP01040 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTAP01040 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTAP01040 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms