Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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NDUFS5O43920 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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NDUFS5O43920 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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NDUFS5O43920 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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NDUFS5O43920 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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NDUFS5O43920 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NDUFS5O43920 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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