Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM35Q9UPQ4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
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