Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAPAQ9P0L0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms